Chargée de Recherche INSERM
Équipe 2MB2C
Nous étudions le lien entre les réarrangements génétiques des gènes d’immunoglobuline et la réparation de l’ADN dans la Leucémie lymphoïde chronique.
Bureau 137 CBRS
05 19 56 42 10
Activité de recherche
La leucémie lymphoïde chronique (LLC) est une hémopathie maligne due à la prolifération monoclonale de lymphocytes B matures. Selon le rapport « Les cancers en France » (Les cancers en France, Les Données/ Epidémiologie. INCa, 2017), on comptait en 2012 en France 35 000 nouveaux cas d’hémopathies malignes par an dont la moitié sont des hémopathies lymphoïdes qui comptent les cancers du lignage lymphocytaire B. La LLC est fréquente chez les adultes et résulte en une lymphocytose (augmentation du compte de lymphocytes), circulatoire et ganglionnaire, qui aboutit à une dérégulation de la réponse immunitaire, augmentant les risques d’infections et de cancers. Les processus oncogéniques de la LLC ne sont pas clairement définis.
En utilisant un outil développé par notre équipe (Boyer et al., J Immunol. 2017) permettant l’analyse des recombinaisons génétiques du locus de la chaîne lourde des immunoglobulines à partir des données de séquençage haut débit, les techniques d’immunoprécipitation de la chromatine et en développant des tests fonctionnels, nous analysons la réparation de l’ADN dans les cellules tumorales de patients atteints de LLC.
Notre objectif est de comprendre les conséquences biologiques d’une dérégulation des mécanismes de réparation de l’ADN dans la transformation tumorale dans la LLC.
En effet, les LB sont des cibles « privilégiées » des lésions de l’ADN. Au cours de leur développement et lorsqu’ils sont matures, les LB subissent des mécanismes physiologiques au cours desquels sont introduites des cassures de l’ADN et/ou des mutations dans les gènes d’Ig. Les réarrangements V(D)J qui permettent l’expression d’une Ig, la commutation isotypique des Ig (CSR) et la recombinaison suicide du locus IgH (LSR) sont des recombinaisons génétiques des loci des chaînes d’Ig. La réparation de l’ADN assure la stabilité génomique dont l’altération peut être à l’origine de pathologies variées, allant d’anomalie du développement au cancer. Aussi, dans notre travail sur la LLC, nous utilisons ces processus physiologiques pour appréhender la réparation de l’ADN dans les cellules B normales et tumorales. Ce travail est aussi l’occasion d’approfondir l’étude du mécanisme de LSR dont la fonction physiologique n’est pas encore élucidée.
Personnels associés :
Kenza Guiyedi (Master 2)
Israa Al Jamal (Doctorante)
Hend Boutouil (Doctorante, 2015-2018)
Nathalie Gachard (PH ; Service d’Hématologie biologique)
David Rizzo (MCU-PH ; Service d’Hématologie biologique)
Jasmine Chauzeix (MCU-PH ; Service d’Hématologie biologique)
Mise à disposition
Le logiciel CSReport (Boyer et al., J Immunol. 2017) permet l’analyse de données de séquençage haut débit de produits de PCR amplifiant les jonctions de recombinaison du locus IgH.
CSReport nécessite les environnements Python3 et Jupyter (de préférence à partir d’une distribution Anaconda) avec un package Biopython mis à jour.
CSReport fonctionne avec une référence personnalisée (dérivée de sources NCBI) d’une séquence de locus IgH constante et d’annotations pour l’Homme ou la souris. La référence doit être choisie en fonction de l’organisme modèle.
Le fichier notebook CSReport (archive ZIP) incluant les fichiers de référence est disponible sur demande par mail.
Collaborations
– Cyril Broccardo, CRCT Toulouse
– Patrick Eldin, IRIM Montpellier
– Saïd Aoufouchi, Institut Gustave Roussy, Villejuif
Enseignement
Depuis 2013 : cours « Mécanismes moléculaires des réarrangements génétiques des gènes d’immunoglobuline » dans l’UE Immunologie-Hématologie-Oncologie, MASTER 2 Biologie-Santé – Oncologie moléculaire et Biothérapies, Faculté des sciences de Limoges.
Parcours
Depuis 2013 : Chargée de recherche INSERM à l’UMR CNRS 7276 INSERM 1262 « Contrôle de la réponse immune B et des lymphoproliférations » (CRIBL) (Directeur : Pr. M. Cogné), Limoges.
2009-2013 : Post-doctorat à l’UMR CNRS 7276 (CRIBL).
2004-2008 : Doctorat en Immunologie, Université Paris VII et Inserm U768 (Directeur : Pr A. Fischer), Hôpital Necker, Paris. Titre de la thèse : “Molecular characterization of inherited immunoglobulin class switch recombination deficiencies”, Directeur : Dr. Anne Durandy.
2003-2004 : DEA d’immunologie approfondie, Université Paris VI et Institut Pasteur, Paris.
1999-2003 : DEUG SVT puis Licence et Maîtrise de biochimie, spécialité immunologie et biochimie microbienne, Université de Poitiers.
Publications
Eldin P, Péron S, Galashevskaya A, Denis-Lagache N, Cogné M, Slupphaug G and Briant L. HIV-1 may evade antibody class switching via Vpr-mediated UNG2 degradation in bystander B cells – Journal of Translational Medicine, 2020.
Boutouil H, Boyer F, Cook-Moreau J, Cogné M, Péron S. IgH locus suicide recombination does not depend on NHEJ in contrast to CSR in B cells. Cell Mol Immunol. 2019 Feb;16(2):201-202.
Dalloul I, Boyer F, Dalloul Z, Pignarre A, Caron G, Fest T, Chatonnet F, Delaloy C, Durandy A, Jeannet R, Lereclus E, Boutouil H, Aldigier JC, Péron S, Le Noir S, Cook-Moreau J, Cogné M. Locus suicide recombination actively occurs on the functionally rearranged IgH allele in B-cells from inflamed human lymphoid tissues. PLoS Genet. 2019 Jun 14;15(6).
Cresson C, Péron S, Jamrog L, Rouquié N, Prade N, Dubois M, Hébrard S, Lagarde S, Gerby B, Mancini SJC, Cogné M, Delabesse E, Delpy L, Broccardo C. PAX5A and PAX5B isoforms are both efficient to drive B cell differentiation. Oncotarget. 2018 Aug 28;9(67):32841-32854.
Boyer F, Boutouil H, Dalloul I, Dalloul Z, Cook-Moreau J, Aldigier JC, Carrion C, Herve B, Scaon E, Cogné M, Péron S. CSReport: A New Computational Tool Designed for Automatic Analysis of Class Switch Recombination Junctions Sequenced by High-Throughput Sequencing. J Immunol. 2017 May 15;198(10):4148-4155.
Srour N, Chemin G, Tinguely A, Ashi MO, Oruc Z, Péron S, Sirac C, Cogné M, Delpy L. A plasma cell differentiation quality control ablates B cell clones with biallelic Ig rearrangements and truncated Ig production. J Exp Med. 2016 Jan 11;213(1):109-22.
Laffleur B, Duchez S, Tarte K, Denis-Lagache N, Péron S, Carrion C, Denizot Y, Cogné M. Self-Restrained B Cells Arise following Membrane IgE Expression. Cell Rep. 2015 Feb 17;10(6):900-909.
Laffleur B, Denis-Lagache N, Péron S, Sirac C, Moreau J, Cogné M. AID-induced remodeling of immunoglobulin genes and B cell fate. Oncotarget. 2014 Mar 15;5(5):1118-31.
Péron S, Laffleur B, Denis-Lagache N, Cook-Moreau J, Filloux M, Cogné M. [IgH locus suicide recombination, or when B cells surrender!]. Med Sci (Paris). 2012
Péron S, Laffleur B, Denis-Lagache N, Cook-Moreau J, Tinguely A, Delpy L, Denizot Y, Pinaud E, Cogné M. AID-driven deletion causes immunoglobulin heavy chain locus suicide recombination in B cells. Science. 2012 May 18;336(6083):931-4.
Tinguely A, Chemin G, Péron S, Sirac C, Reynaud S, Cogné M, Delpy L. Cross talk between immunoglobulin heavy-chain transcription and RNA surveillance during B cell development. Mol Cell Biol. 2012 Jan;32(1):107-17.
Pinaud E, Marquet M, Fiancette R, Péron S, Vincent-Fabert C, Denizot Y, Cogné M. The IgH locus 3′ regulatory region: pulling the strings from behind. Adv Immunol. 2011;110:27-70.
Péron S, Metin A, Gardès P, Alyanakian MA, Sheridan E, Kratz CP, Fischer A, Durandy A. Human PMS2 deficiency is associated with impaired immunoglobulin class switch recombination. J Exp Med. 2008 Oct 27;205(11):2465-72.
Etzioni A, Ben-Barak A, Peron S, Durandy A. Ataxia-telangiectasia in twins presenting as autosomal recessive hyper-immunoglobulin M syndrome. Isr Med Assoc J. 2007 May;9(5):406-7.
Durandy A, Taubenheim N, Peron S, Fischer A. Pathophysiology of B-cell intrinsic immunoglobulin class switch recombination deficiencies. Adv Immunol. 2007;94:275-306. Review.
Péron S, Pan-Hammarstrom Q, Imai K, Du L, Taubenheim N, Sanal O, Marodi L, Bergelin-Besançon A, Benkerrou M, de Villartay JP, Fischer A, Revy P, Durandy A. A primary immunodeficiency characterized by defective immunoglobulin class switch recombination and impaired DNA repair. J Exp Med. 2007 May 14;204(5):1207-16.
Durandy A, Peron S, Taubenheim N, Fischer A. Activation-induced cytidine deaminase: structure-function relationship as based on the study of mutants. Hum Mutat. 2006 Dec;27(12):1185-91. Review.
Durandy A, Peron S, Fischer A. Hyper-IgM syndromes. Curr Opin Rheumatol. 2006 Jul;18(4):369-76. Review.
Notarangelo LD, Lanzi G, Peron S, Durandy A. Defects of class-switch recombination. J Allergy Clin Immunol. 2006 Apr;117(4):855-64. Review.