L’Université de Limoges recrute deux bio-informaticiens

Lieu de travail : Institut de Recherche GEIST – Centre de Biologie en Recherche et en Santé (CBRS)

Type de poste : Niveau Ingénieur d’études, CDD 1 an. Possibilité de prolongation d’1 année.

L’Institut GEIST de l’Université de Limoges est constitué de 12 équipes de recherche travaillant dans les domaines de la Biologie, de la Santé et de l’Environnement. L’Institut GEIST structure une unité de service comprenant des pôles technologiques (génomique, protéomique, imagerie,…) et une cellule bio-informatique pour les équipes de recherche de l’Institut GEIST. Les nouveaux candidats recrutés rejoindront cette structure.

Descriptif des postes :

• 1 poste BioInfo « génomique » : bioanalyse de données haut-débit de génomique et de transcriptomique
• 1 poste BioInfo « protéomique » : conception, développement et intégration de workflows en bioinformatique pour l’analyse de données de protéomique par spectrométrie de masse à haute résolution.

Missions – Activités

1. Analyse des données et conseils méthodologiques aux utilisateurs.
2. Veille technologique du domaine, développement et entretien des workflows d’analyse, mise en place des procédures standardisées de traitement des données, développement de nouveaux pipelines, outils statistiques ou de visualisation nécessaires à l’analyse et à l’intégration des données
3. Participation à la rédaction des sections spécialisées des articles scientifiques
4. Mise en place d’interfaces accessibles aux collaborateurs pour le transfert, le stockage, le contrôle qualité et l’analyse des données
5. Support technique et formation aux outils développés.

Compétences

• Expérience réussie en bioinformatique, appliquée à la génomique, la transcriptomique, ou la protéomique par spectrométrie de masse
• Connaissance des techniques de programmation :
  –  R/Bioconductor, Python, Perl
  – Maîtrise des logiciels requis pour l’analyse de données en génomique (STAR, bowtie2, picard,samtools,…)
  – Connaissance en administration système sous Unix/Linux, Shell
• Compétences en biostatistiques (volcanoplots, méthodes de pca, spls, opls et discriminant analyses, random forest, régressions pénalisées, SVM, évaluation des méthodes diagnostiques et des examens biologiques-concordance, reproductibilité, sensibilité, spécificité, courbes ROC-, …)
• Connaissance d’outils d’analyse d’expression et de réseaux (GSEA, Expression Console, Transcriptome Analysis Console Software, Cytoscape, …).
• Capacités organisationnelles, aptitude à la présentation synthétique et didactique des résultats scientifiques.

Candidatures 

Les candidats devront fournir un CV complet, une lettre de motivation et les coordonnées de 2 référents par mail à l’adresse :

Dépôt des candidatures : avant le 22 août 2016

Prise de fonction : Octobre 2016

 Nom des contacts :
Véronique BLANQUET – Tél : 06 89 42 81 04
Anne DRUILHE – Tel : 06 73 26 46 77