P&T – Pharmacologie & Transplantation
UMR Inserm-CHU 1248


Présentation

Pierre MARQUET – Directeur
Tél. : + 33 (0)5 19 56 42 50

Adresse : UMR1248 P&T, CBRS,                                          1 rue Bernard Descottes, 87000 Limoges

SITE WEB

TutellesUniversité de LimogesInserm – CHU de Limoges
Institut d’appartenanceOmegaHealth

Ecole doctoraleBiologie, Chimie, Santé

Master recherche associé : Master Relations Hôte-Greffon : interaction immunologique et ingénierie cellulaire, Universités de Franche-Comté et Paris-Saclay

Indicateurs personnels (Mai 2024)

Enseignants-chercheurs : 14

Chercheurs EPST ou EPIC : 2

Auutres chercheurs : Post-doctorants, chercheurs invités, PH , médecins et pharmaciens du CHU (durée supérieure à 3 mois) : 10

HDR : 9

Doctorants : 8

Ingénieurs et techniciens : 9

Personnel Administratif : 1

Thèses soutenues : 15

Projets en cours

Liste des ANR en cours : IMOTEP, ANR JCJC 2019 (Coord.)

RAPRACLID, ANR PRCE 2021 (Partenaire)

Autres projets en cours : REXETRIS, Financement Health Data Hub 2019, consortium DIGPHAT PEPR Santé Numérique

Production scientifique (2012-2016)

Articles internationaux : environ 60 articles par an par les membres de l’UMR1248, dont 15 à 20 par an dans les thématiques strictes de l’unité

Chapitres d’ouvrage : 3 par an en moyenne

Nombre de communications dans des congrès (nationaux, internationaux) : > 20 par an

Autres     

Prix et distinctions :

– Dr. Jean-Baptiste Woillard – IFCC-Gérard Siest Young Scientist Award for Distinguished Contributions in Pharmacogenetics, 2020

–  Prof. Patrick Trouillas – Laureate at the Cosmetic Victories (Innovation Award – Academic Price) – 2017

–  Prof. Patrick Trouillas – Award of the best foreign scientist of the Regional Center of Advanced Technologies and Materials (Czech Republic) – 2015

–   Dr. Benjamin Chantemargue – Best oral presentation – EJTEMM 2018 (European Joint Theoretical and Experimental Meeting on Membranes), Helsinki, Finland

–   Dr. Souleiman El Balkhi – Best oral presentation – 15th IATDMCT congress (International Association of Therapeutic Drug Monitoring & Clinical Toxicology), Kyoto, Japan – 2017

–  Dr. Roland Lawson – Poster award – XXIIth SFPT conference (Société Française de Pharmacologie et de Thérapeutique), 2018, France

–    Dr. Florent Di Meo – Horizon Dalton Prize 2022 – Royal Society of Chemistry  

10 publications et/ou brevets majeurs des 5 dernières années :

1) Jardou M, Provost Q, Brossier C, Pinault É, Sauvage FL, Lawson R. Alteration of the gut microbiome in mycophenolate-induced enteropathy: impacts on the profile of short-chain fatty acids in a mouse model. BMC Pharmacol Toxicol. 2021 Oct 28;22(1):66. doi: 10.1186/s40360-021-00536-4.

2) Jardou M, Brossier C, Guiyedi K, Faucher Q, Lawson R. Pharmacological hypothesis: A recombinant probiotic for taming bacterial β-glucuronidase in drug-induced enteropathy. Pharmacol Res Perspect. 2022 Oct;10(5):e00998. doi: 10.1002/prp2.998.

3) Woillard JB, Labriffe M, Debord J, Marquet P. Tacrolimus Exposure Prediction Using Machine Learning. Clin Pharmacol Ther. 2021 Aug;110(2):361-369.

4) Woillard JB, Monchaud C, Saint-Marcoux F, Labriffe M, Marquet P. Can the Area Under the Curve/Trough Level Ratio Be Used to Optimize Tacrolimus Individual Dose Adjustment? Transplantation. 2023 Jan 1;107(1):e27-e35

5) Labriffe M, Woillard JB, Gwinner W, Braesen JH, Anglicheau D, Rabant M, Koshy P, Naesens M, Marquet P. Machine learning-supported interpretation of kidney graft elementary lesions in combination with clinical data. Am J Transplant. 2022 Dec;22(12):2821-2833.

6) Lakis R, Sauvage FL, Pinault E, Marquet P, Saint-Marcoux F, El Balkhi S. Semi-synthetic human albumin isoforms: Production, structure, binding capacities and influence on a routine laboratory test. Int J Biol Macromol. 2023 Aug 10;250:126239. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2023.126239.

7) Tóth Á, Janaszkiewicz A, Crespi V, Di Meo F. On the interplay between lipids and asymmetric dynamics of an NBS degenerate ABC transporter. Comm Biol 2023 Feb 03;6(1):149. doi: 10.1038/s42003-023-04537-3.

8) Janaszkiewicz A, Tóth Á, Faucher Q, Arnion H, Védrenne N, Barin-Le Guellec C, Marquet P, Di Meo F. Substrate binding and lipid-mediated allostery in the human organic anion transporter 1 at the atomic-scale. Biomed Pharmacother. 2023 Apr;160:114342. doi: 10.1016/j.biopha.2023.114342.

9) Aouad H, Faucher Q, Sauvage FL, Pinault E, Barrot CC, Arnion H, Essig M, Marquet P. A multi-omics investigation of tacrolimus off-target effects on a proximal tubule cell-line. Pharmacol Res. 2023 Jun;192:106794. doi: 10.1016/j.phrs.2023.106794.

10) Faucher Q, Chadet S, Humeau A, Sauvage FL, Arnion H, Gatault P, Buchler M, Roger S, Lawson R, Marquet P, Barin-Le Guellec C. Impact of hypoxia and reoxygenation on the extra/intracellular metabolome and on transporter expression in a human kidney proximal tubular cell line. Metabolomics. 2023 Sep 13;19(9):83. doi: 10.1007/s11306-023-02044-4.

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Recherche

L’UMR1248 regroupe des chercheurs pharmacologues, chimistes, physiologistes, immunologistes et cliniciens et du personnel de soutien à la recherche pour mener à bien sa thématique de médecine personnalisée en transplantation.

Thèmes de recherche en cours :

–    Pharmacologie théorique et structurale : insertion passive des médicaments dans les membranes cellulaires et perméation ; modèles structuraux de transporteurs membranaires et polymorphismes génétiques ; fonctions des transporteurs membranaires et interactions médicamenteuses les impliquant

–        Transporteurs, biomarqueurs et lésions des greffons : biomarqueurs de lésions des greffons rénaux

–        Microbiote intestinal et médecine de précision en transplantation : Rôle du microbiote intestinal et des acides gras à chaîne courte dans les rejets de greffon ; supplémentation des liquides de conservation des organes avec des acides gras à chaîne courte ; rôle du microbiote intestinal dans les effets indésirables digestifs sévères des médicaments immunosuppresseurs : IgA et microbiote intestinal en transplantation.

–        Modifications de l’albumine comme biomarqueurs des pathologies hépatiques

–   Pharmacométrie, modélisation et Intelligence Artificielle (IA) : estimation de l’exposition des patients aux médicaments immunosuppresseurs ; relations entre l’exposition combinée aux immunosuppresseurs et leurs effets à long terme ; efficacité de l’individualisation thérapeutique par méthode pharmacocinétique à l’échelle nationale ; déterminants, modèles et prédicteurs de l’évolution de la fonction des greffons à long terme ; pharmacologie de système des médicaments immunosuppresseurs.

Thèmes de Recherche :

Médecine de précision en transplantation. Recherche translationnelle visant à améliorer la survie des organes greffés et la qualité de vie des patients : identification des facteurs de variabilité de la réponse aux traitements, conception d’outils ou de stratégies d’individualisation thérapeutique, validation et transfert clinique.

Mots-clés :

Pharmacologie, Transplantation, Immunosuppresseurs, Chimie Théorique, Microbiote, Biomarqueurs, Intelligence Artificielle, Pharmacogénétique, Recherche translationnelle, Recherche clinique

Equipements / Ressources techniques

Spectrométrie de masse ; Analyses protéomiques et métabolomiques ; Culture cellulaire ; Organes sur puces ;  Biologie moléculaire ; Modélisation pharmacocinétique ; Modélisation de la maladie ; Modélisation moléculaire ; Intelligence artificielle

Plate-forme technique

Prestations

Conseil, expertise et formation sur le médicament (pharmacocinétique, pharmacogénétique, pharmacodynamie, recherche clinique, etc.)

Conseil et expertise en modélisation moléculaire

Recherche et développement

Secteurs d’application:  Santé, Pharmacie, Bio-industrie (pharmacologie, transplantation d’organes)

Applications industrielles

Le site internet ABIS/ISBA d’individualisation thérapeutique des médicaments immunosuppresseurs chez les patients transplantés, développé à partir des résultats de l’UMR1248 P&T, a reçu près de 150,000 demandes depuis 2005, provenant d’une centaine de centres de transplantation, dont près de la moitié à l’étranger (sur tous les continents). L’activité du site pour la France est financée par une facturation inter-hôpitaux.

Par ailleurs, l’UMR1248 a transféré d’autres outils de surveillance des patients transplantés à sa start-up Optim’Care, et ses activités de prestations de service en modélisation moléculaire à sa seconde start-up InSiliBio.

Valorisation

Nombre de brevets déposés (distinguer les logiciels, licences…) : 5  

Préciser le nombre en copropriété : 5

Liste des entreprises créées issues des activités de recherche depuis 2005 : Optim’Care (2018) ; InSiliBio (2019)

Liste des pôle(s) de compétitivité auxquels le laboratoire est associé : ALLIS NA

Partenariats

Collaborations nationales actives Université, organismes, institutions : 

U1082 IRTOMIT Inserm / Université de Poitiers

U1092 RESINFIT Inserm / Université de Limoges

EA4245 Transplantation, Immunologie & Inflammation, Université de Tours

Vaste réseau de collaboration avec les centres de transplantation d’organes en France :

U1193 Physiopathogénèse et Traitement des Maladie du Fois Inserm / Université Paris Saclay

U6521 COSM CNRS / Université de Bretagne Occidentale

U1078 GGB / Université de Bretagne Occidentale

U7590 IMPMC CNRS IRD / Sorbonne Université

Collaborations universitaires internationales en cours : 

University Palacky, Olomouc, République Tchèque

LAPK, Los Angeles, USA

Hôpital Sainte-Justine, Quebec, Canada.

Réseau financé par ANR internationale avec : KU Leuven, Belgique ; MHH Hanover, Allemagne Hôpital Necker, APHP Paris.

Van der Schaar Lab, CCAIM, Cambridge, United Kingdom

Clinical Pharmacology and Therapeutics, Saint Vincent’s clinical school, UNSW Medicine, Sydney, Australia

Clinical Pharmacology, Department of Medicine, University of Otago, Christchurch, New-Zealand

Division of Pharmacology, Department Utrecht University, Pays-Bas

Partenariats industriels : contrats de recherche clinique ou translationnelle avec Roche, Astellas, Novartis-Sandoz, Chiesi, MedIncell, Womed, InSiliBio, Optim’Care

Partenariats avec des organismes et institutions nationaux : Health Data Hub

Fédérations de Recherche (FR) : FHU SUPORT avec les CHU et les Universités de Limoges, Poitiers, Tours, Nantes, Rennes et Angers

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